Инженеры-генетики Рослесозащиты приступили к внедрению в свою деятельность новых генетических анализаторов «Нанофор 05». Оборудование поставлено в рамках федерального проекта «Сохранение лесов» национального проекта «Экологическое благополучие» в Центры защиты леса Алтайского, Красноярского и Хабаровского краёв, а также Воронежской области. Работа по наладке и тестированию анализаторов проходила непосредственно на местах, в отделах оценки состояния лесных ресурсов генетическими методами, совместно с представителями одной из компаний-разработчиков. Специалисты филиалов Рослесозащиты перед этим прошли соответствующее обучение работе на новых приборах.
«Нанофор 05» – это первый серийный российский генетический анализатор, созданный, в том числе, с участием Института аналитического приборостроения Российской академии наук. Он представляет собой полностью автоматический восьмикапиллярный прибор для секвенирования ДНК и фрагментного анализа. По ряду ключевых характеристик он существенно превосходит однокапиллярные приборы, ранее используемые инженерами Рослесозащиты. Главное отличие – количество одновременно работающих капилляров: вместо одного капилляра работают сразу восемь, что позволяет обрабатывать в восемь раз больше образцов.
Если говорить кратко, секвенирование – это расшифровка генетического кода, чтение последовательности «букв», из которых состоит ДНК любого живого организма, в том числе растений, насекомых, грибов. Применение фрагментного анализа при изучении микросателлитных повторов, характерных для геномов разных пород деревьев, позволяет проводить детальный популяционный анализ лесных растений и выявлять их генетическое разнообразие. Под микросателлитами понимаются короткие, многократно повторяющиеся участки ДНК, которые словно «отпечатки пальцев»: у каждой породы деревьев и даже у разных популяций одной породы их набор уникален.
В специализированных отделах учреждения, выполняющих ДНК-анализы лесных растений, продолжается обновление приборной базы в целях успешной реализации одного из мероприятий федерального проекта «Сохранение лесов» – получения данных исследований для создания референсной базы генетических данных основных лесообразующих пород нашей страны.
